Pagrindinis Muziejaus veiklos tikslas – kaupti, saugoti, tyrinėti, konservuoti, eksponuoti ir populiarinti zanavykų krašto kultūrą atspindinčius ir vietos bendruomenei reikšmingus muziejinių vertybių rinkinius.

Muziejaus veiklos uždaviniai :

• Kaupti, tirti ir sisteminti muziejinę bei istorinę, etnografinę vertę turinčias muziejines vertybes (eksponatus), formuoti  ir sisteminti sukauptus Muziejaus rinkinius, kurie atspindi zanavykų krašto istoriją nuo seniausių laikų iki šių dienų;
• Užtikrinti sukauptų muziejinių vertybių apskaitą, tinkamas saugojimo sąlygas ir apsaugą, jų konservavimą ir restauravimą;
• Sudaryti sąlygas Muziejuje saugomų muziejinių vertybių viešam naudojimui: rengti ekspozicijas, parodas, organizuoti su Muziejaus veikla susijusius kultūros ir edukacinius renginius (minėjimus, susitikimus, pristatymus ir kt.) bei vykdti edukacines programas Lietuvoje ir užsienyje;
• Vykdyti muziejinių vertybių skaitmeninimą ir jų viešinimą per integralią muziejų informacinę sistemą LIMIS, bendradarbiauti skaitmeninimo projektuose;
• Plėtoti lankytojų aptarnavimo paslaugas Muziejuje, teikti mokamas muziejaus paslaugas, vadovaudamasis Savivaldybės tarybos nustatytais įkainiais;
• Valdyti, saugoti ir naudoti rajono savivaldybės tarybos perduotą turtą;
• Organizuoti tikslines istorines, etnografines ekspedicijas, pristatyti rezultatus visuomenei;
• Kurti programas, kuriomis siekiama aktyviai įsitraukti į neformaliojo švietimo, darbo su jaunimu bei mokymosi visą gyvenimą procesą, sudaryti galimybes mokytis įvairių kartų žmonėms;
• Vykdyti edukacinę veiklą, aktyviai bendradarbiauti su įvairiomis švietimo ir neformaliojo ugdymo įstaigomis;
• Bendradarbiauti su Lietuvos ir užsienio muziejais, kultūros, turizmo bei kitomis įstaigomis, nevyriausybinėmis organizacijomis;
• Organizuoti savanorišką veiklą Muziejaus tikslams pasiekti;
• Organizuoti dienos užimtumą darbingo amžiaus asmenims su negalia. Ugdo, lavina ir palaiko  jų bendruosius ir specialiuosius darbinius įgūdžius, atliekant prasmingas darbinio užimtumo veiklas, nukreiptas į konkrečios prekės (produkto) gamybą ir (ar) paslaugos atlikimą;
• Dalyvauti Lietuvos muziejų asociacijos, Lietuvos savivaldybių muziejų bendrijos veikloje;
• Rengti paskaitas, seminarus, konferencijas ir kitus su muziejaus veikla susijusius kultūrinius renginius;
• Dalyvauti projektinėje veikloje, įgyvendinti kultūrinio bendradarbiavimo projektus Lietuvoje ir užsienyje;
• Pristatyti Muziejaus rinkinius ir veiklą interneto svetainėje bei ją reguliariai atnaujinti;
• Rengti muziejaus veiklą reglamentuojančius dokumentus;
• Teikti metodinę pagalbą rajono švietimo ir kultūros įstaigoms kraštotyros srityje;
• Teikti metinę veiklos ataskaitą Savivaldybės tarybai ir Kultūros ministerijai;
• Vykdyti kitas Lietuvos Respublikos teisės aktais nustatytas funkcijas.